Sejak nenek Hayato meninggal dunia, ia memiliki rencana untuk menjual kafe tua milik sang nenek yang berada di pantai. Namun, Hayato tidak mengetahui bahwa kafe tersebut rupanya menjadi tempat tinggal untuk lima wanita muda yang menyebut diri mereka sebagai keluarga dari sang nenek.
Walau telah mengetahui hal ini, Hayato masih tetap bertekad untuk menutup café tersebut. Namun, kelima wanita ini meyakinkan Hayato untuk tetap membuka kafe tersebut dan ia pun menyetujuinya. Sayangnya, mempertahankan sebuah kafe yang sudah tidak begitu populer cukup sulit bagi Hayato.
Tetapi, ia tidak menyerah dan mencoba menyusun berbagai rencana. Lantas, apakah Hayato dan kelima wanita muda nakal ini mampu mengembalikan kepopuleran kafe tersebut?
Tonton juga kelanjutannya, Megami no Cafe Terrace Season 2.